长期使用艾草叶的副作用：如果挥发油(香味成分)使用过多，对神经会有抑制。
艾草的抗菌作用：
艾草在体外对炭疽杆菌、α-溶血链球菌、B-溶血链球菌、白喉杆菌、假白喉杆菌、肺类双球菌、金黄色葡萄球菌、柠檬色葡萄球菌、白色葡葡球菌、枯草杆菌等10种革兰氏阳*嗜气菌皆有抗菌作用。艾草油4×10(-3)浓度(试管法)，对肺炎双球菌、金黄色葡萄球菌、白色葡萄球菌、甲型链球菌、大肠杆菌、伤寒杆菌、副伤寒杆菌、福氏痢疾杆菌等有抑菌作用。以野艾草、艾条或艾绒烟熏，可用于室内消毒，与苍术或与菖蒲及雄黄或与苍术、雄黄、白芷等混合烟重，对金黄色葡萄球菌、乙型溶血*链球菌、大肠杆菌、变形杆菌、白喉杆菌、伤寒及副伤寒杆菌、绿脓杆菌、枯草杆菌、产碱杆菌以及结核杆菌(人型H37RV)均有杀灭或抑制作用。
艾草的副作用 使用过多抑制神经
艾条烟熏尚能减少烧伤创面的细菌。豚鼠结核经艾灸治疗后，疾病进展较慢，病变较轻，尤以病程后期更明显;此外还能增强网状内皮细胞的吞噬反应，但所增强的程度不如动物获得免疫*时那样显著;豚鼠网状内皮系细胞的吞噬机能与内脏的结核病变是一致的，当肝、脾受到疾病的损害时，吞噬机能即下降。
以小野艾草烟熏，对于多种致病真菌也有抑菌作用。小野艾水浸剂及煎剂，在试管内对多种致病真菌也有一定的抑制作用。
野艾的水煎剂，在试管内对金黄色葡萄球菌、α-溶血*链球菌、肺炎双球菌、白喉杆菌、宋内氏痢疾杆菌、伤寒及副伤寒杆菌、霍乱弧菌等均有不同程度的抑制作用。
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