首先，需要明确的是，总督和巡抚都是地方官员，但是他们的职责和权力是不同的。总督主要负责军事、民政和财政等方面的事务，而巡抚则主要负责地方治安、司法和教育等方面的事务。因此，在地方官员中，总督的职权最大，而巡抚的职权则相对较小。
在清代，总督和巡抚都有自己的管辖区域。总督通常管辖一个或多个省份，而巡抚则通常管辖一个或多个府或州。因此，在管辖区域上，总督和巡抚存在重叠的部分。如果一个地方官员要听从另一个地方官员的命令，那么通常是由他所管辖的上级官员来决定。
具体来说，如果一个地方官员的上级官员是另一个总督，那么他就必须遵从该总督的命令。如果他的上级官员是另一个巡抚，那么他可能需要与该巡抚协商后再做出决定。但是，如果他的上级官员是同级别的其他官员，那么他就可以自行决定是否遵从该官员的命令。
在实际的行政过程中，地方官员往往会受到不同因素的影响，包括上级官员的态度、下级官员的意见、地方实际情况等等。因此，在清代地方行政中，地方官员要听从上级官员的命令，但也有一定的自主权和灵活性。
总之，在清代地方行政中，总督和巡抚虽然都是正二品的高级地方官员，但他们的职责和权力是不同的。地方官员要听从上级官员的命令，但也有一定的自主权和灵活性。这种行政体制既保证了中央集权的稳定性，又保障了地方自治和地方官员的实际权力。
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